Музей Мирового океана организован решением Правительства РСФСР 12 апреля 1990 года. Согласно Уставу Музей Мирового океана является республиканским центром научных исследований и научно-методической работы в области изучения истории исследования и природы океана. В Музее Мирового океана создана единственная в стране Набережная исторического флота, у причала которой ошвартованы: самое крупное в мире научно-исследовательское судно-музей "Витязь" (1994), единственная в стране подводная лодка-музей 641-го проекта на плаву "Б-413" (2000), единственное в мире судно космической связи "Космонавт Виктор Пацаев", имеющее музейную экспозицию (2001), единственное в стране рыболовное судно-музей "СРТ-129" (2009). Набережная исторического флота протянулась до Санкт-Петербурга, где ошвартован старейший в мире ледокол "Красин", являющийся филиалом музея (2004). На судах представлена история исследования и освоения Мирового океана.